Режим особой охраны памятника природы приведен в постановлении Правительства Калужской области от 11 апреля 2017 г. № 202
«Об объявлении Милятинского водохранилища особо охраняемой природной территорией регионального значения - памятником природы»
На территории памятника природы запрещается:
— строительство зданий, сооружений и иных объектов, дорог и трубопроводов, линий электропередачи и прочих коммуникаций, не связанное с обеспечением функционирования памятника природы;
— нарушение почвенного покрова, производство земляных работ, за исключением проведения мероприятий по сохранению и восстановлению памятника природы;
— проведение геологоразведочных работ, поиск и добыча полезных ископаемых;
— деятельность, влекущая за собой изменение гидрологического режима;
— загрязнение и засорение поверхностных и подземных вод, сброс сточных вод;
— применение удобрений и ядохимикатов;
— рубка древесной и кустарниковой растительности, нарушение растительного покрова, за исключением проведения научных исследований и мероприятий по сохранению и восстановлению памятника природы;
— уничтожение редких и находящихся под угрозой исчезновения объектов растительного и животного мира, занесенных в Международную Красную книгу, Красную книгу Российской Федерации и (или) Красную книгу Калужской области, а также действия, которые могут привести к гибели, снижению численности, сокращению ареала распространения или нарушению среды их обитания (произрастания);
— сброс отходов производства и потребления вне специально отведенных для этого мест, складирование, размещение, захоронение всех видов отходов, материалов, грунтов, снега;
— движение и стоянка моторных лодок, гидроциклов и иных водных моторных транспортных средств, за исключением специальных транспортных средств и транспортных средств, используемых в целях охраны и изучения территории памятника природы;
— повреждение ограждений, информационных знаков, стендов, указателей и других объектов инфраструктуры памятника природы.